1С ЗУП 3.1: Автоматическая нумерация документов
Как правило, нумерация документов в 1С осуществляется в пределах года, т.е. каждый год первый документ в новом году будет иметь номер вида 0000-000001. Если для организации установлен префикс, то он также будет отображаться в составе номера. Префикс указывается в карточке организации и представляет из себя 2 символа.

При создании нового документа его номер присваивается системой автоматически по порядку, например 0000-000002, 0000-000003. При попытке ручного изменения номера программа выдаст предупреждение

При утвердительном ответе вы сможете установить желаемый номер документа.
Но! Если хотя бы один раз вручную поправить номер, например, вставив в него букву, то система «снимает с себя ответственность» по автоматической нумерации данного типа документа и это становится ответственностью пользователя.
При попытке записи документа с номером, который уже существует в системе, программа выдаст предупреждение «Значение поля Номер не уникально»

В этом случае вам нужно сменить номер на такой, который еще ни разу не встречался с начала года для данного типа документа.
Теперь вам по зубам настройка нумерации документов в ЗУП 3.1!